Table des matières, documentation de LASE

Ce document contient non seulement le sommaire des différentes parties de la documentation de LASE, mais aussi quelques commentaires sur le contenu.

Rappelons tout d'abord que LASE est, fondamentalement, un logiciel d'analyse des spectres EXAFS. Même s'il dispose de quelques fonctions plus générales, la majorité des options sont prévues dans ce cadre.

Présentation du programme

Quelques remarques générales sur le programme, sur son installation.

Prise en main du logiciel

Présente les possibilités de base de LASE dans le traitement des spectres EXAFS. Après lecture, vous saurez extraire un spectre EXAFS, le filtrer et l'ajuster à partir d'un modèle théorique. Dans l'ensemble, les options présentées ici ne sont pas spécifiques de LASE &emdash; seules les possibilités de l'interface sont particulières.

Études statistiques

Ou comment faire une étude statistique complète avec LASE, en partant de plusieurs fichiers expérimentaux : depuis l'estimation des erreurs point par point jusqu'à l'estimation des incertitudes statistiques sur les paramètres ajustés par la méthode de Monte-Carlo.

Modèles structuraux

Ou comment construire un modèle structural à partir de coordonnées atomiques, le modifier, le transformer en un modèle utilisable pour des calculs théoriques et s'en servir pour faciliter les ajustements des modèles théoriques à l'expérience.


Notice exhaustive des fonctions

Généralités

Options de la ligne de commande, fonctionnement de la fenêtre principale.

Parties communes

Les parties de l'interface qui reviennent fréquemment dans LASE sont décrites ici, plutôt qu'à chacune de leur apparition dans la documentation des diverses options. Il s'agit, par exemple, du sélecteur de graphes.

Options du menu « LASE »

Menu LASE

Ces options permettent principalement de basculer d'une série de commande à une autre (différents modes de fonctionnement de LASE : extraction des spectres, calculs théoriques, création de modèles structuraux, ajustements).


Commandes en mode « extraction »

Options du menu « Fichiers »

Ce menu regroupe les principales options permettant de charger et sauver des fichiers, soit au format propre à LASE soit dans le but de communiquer avec d'autres logiciels (formats ASCII, postscript).
Menu Fichier
  • Charger... au format propre à LASE
  • Sauver... au format propre à LASE
  • Importer ASCII...
  • Importer FEFF...
  • Exporter en ASCII
  • Exporter une image (essentiellement du postscript)
  • Quitter
  • Options du menu « Graphes »

    Ce menu regroupe les principales options permettant de travailler sur un ou plusieurs graphes, et qui ne sont pas spécifiques du traitement des spectres d'absorption des rayons X.
    Menu Graphes
  • Liste des graphes (couleur, nom,...)
  • Effacer tous les graphes
  • Tronquer... un graphe
  • Dériver... un graphe
  • Intégrer... un graphe
  • Enlever une aberrance
  • Décomposer sur 2 spectres
  • Fondre des graphes
  • Opérations diverses
  • Moyenner des graphes
  • Options du menu « Absorption  »

    Ce menu regroupe les principales options permettant de traiter un spectre d'absorption des rayons X expérimental de façon à obtenir l'absorption totale de l'atome étudiée.
    Menu Absorption
  • Extraire le signal brut des fichiers expérimentaux
  • Calculer le signal à partir des intensités
  • Correction d'énergie
  • Tout faire pour obtenir un spectre X.A.N.E.S.
  • Soustraire µ(matrice)
  • Normaliser un spectre X.A.N.E.S.
  • Dérivée première d'un spectre X.A.N.E.S.
  • Dérivée seconde d'un spectre X.A.N.E.S.
  • Intégrer le préseuil
  • Options du menu « E.X.A.F.S. »

    Ce menu regroupe les principales options permettant d'extraire les oscillations E.X.A.F.S. à partir des spectres d'absorption expérimentaux.
    Menu EXAFS
  • Chercher E0
  • Multiplier par kn
  • Conversion k <-> E
  • Tout faire...
  • Soustraire µ(matrice)
  • Soustraire µ0 (grossier)
  • Soustraire µ0 (fin)
  • Soustraire µ0 (très fin)
  • Soustraire µ0 calculé
  • Normaliser
  • Reproduire l'extraction
  • Options du menu « Filtrage »

    Ce menu regroupe les principales options permettant de filtrer le signal E.X.A.F.S., que ce soit pour en diminuer le bruit ou pour en isoler les contributions.

    Menu Filtrage
  • Calculer la T.F.
  • Calculer la T.F.I.
  • Reproduire le filtrage
  • Corriger l'amplitude
  • Corriger la phase
  • Options du menu « Erreurs »

    Ce menu regroupe les principales options permettant une analyse statistique des spectres d'absorption expérimentaux.

    Menu Erreurs
  • Moyenne & variance
  • Barres d'erreur
  • Corrélations
  • Estimation d'une distribution
  • Test de Kolmogorov-Smirnov
  • Test de Cramer-von Mises
  • Options du menu « Tracé »

    Ce menu permet d'ouvrir la fenêtre de superposition des graphes, qui permet la comparaison graphique de différents spectres et la préparation de figures simples à partir de ces spectres.

    Menu

    Commandes en mode « calculs théoriques »

    Options du menu « Extraction »

    Options du menu « XAS »

    Ce menu regroupe les principales options permettant de calculer à partir d'un modèle théorique les composantes du signal EXAFS et de les combiner pour retrouver les oscillations EXAFS (pour les cas simples).
    Menu XAS

    Options du menu « Préseuil »

    Options du menu « Err Syst »

    Options du menu « FEFF »

    Ce menu regroupe les options permettant de configurer les options utilisées par le logiciel FEFF pour calculer un spectre d'absorption théorique, ou ses oscillations EXAFS.
    Menu FEFF


    Commandes en mode « ajustements »

    Options du menu « Général »

    Options du menu « Couches »

    Ce menu regroupe les options permettant d'ajuster sur un spectre EXAFS expérimental un modèle « classique » d'oscillations EXAFS, conçu comme une somme de termes, chaque terme correspondant à un chemin de diffusion simple ou multiple (approche utilisée par FEFF pour les calculs théoriques).
    Menu Couches


    Commandes en mode « modèle structural »


    Emmanuel CURIS
    Last modified: Thu Feb 6 18:41:01 CET 2003